Le MIAAO se trouve dans les anciens cloitres du complexe monumental dessiné par Juvarra, à San Filippo Neri, où, en plus de Filippo Juvarra, travaillèrent d’illustres architectes tels que Guarino Guarini et Giuseppe Maria Talucchi.
Le musée conserve de nombreux chef-d’œuvres d’art déco comme le célèbre Paliotto de Pietro Piffetti et certaines œuvres importantes contemporaines d’art appliqué, exposés dans des lieux sacrés comme la Chiesa Maggiore, le Baptistère et le cimetière.