Le territoire de San Benigno se situe entre les ruisseaux Malone et Orco : majoritairement plat, il comprend également une petite partie de la colline morainique connue sous le nom de Vauda. L'histoire de la commune est étroitement liée à celle de la célèbre Abbaye de Fruttuaria, fondée en 1003 par Guglielmo da Volpiano.
Le centre historique comprend le Ricetto et une zone plus large qui dessine un quadrilatère délimité par les chapelles des quatre principaux villages.
Du Ricetto médiéval (années 1400), il reste une des trois portes et une des tours d'angle, ainsi que des traces d'autres tours. Des parties de fenêtres à meneaux et des décorations en terre cuite sont encore visibles sur certaines façades.